Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
AFPP02771 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
AFPP02771 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
AFPP02771 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFPP02771 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFPP02771 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
AFPP02771 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
AFPP02771 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
AFPP02771 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFPP02771 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFPP02771 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFPP02771 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFPP02771 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFPP02771 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFPP02771 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFPP02771 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
AFPP02771 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFPP02771 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFPP02771 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFPP02771 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFPP02771 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
AFPP02771 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
AFPP02771 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFPP02771 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFPP02771 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFPP02771 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFPP02771 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
AFPP02771 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
AFPP02771 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFPP02771 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFPP02771 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFPP02771 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
AFPP02771 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFPP02771 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFPP02771 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
AFPP02771 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
AFPP02771 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFPP02771 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFPP02771 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
AFPP02771 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFPP02771 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
AFPP02771 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFPP02771 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFPP02771 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFPP02771 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
AFPP02771 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
AFPP02771 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFPP02771 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
AFPP02771 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFPP02771 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFPP02771 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFPP02771 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFPP02771 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
AFPP02771 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
AFPP02771 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFPP02771 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFPP02771 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AFPP02771 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFPP02771 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFPP02771 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AFPP02771 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFPP02771 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AFPP02771 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFPP02771 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AFPP02771 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFPP02771 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFPP02771 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFPP02771 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFPP02771 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
AFPP02771 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
AFPP02771 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
AFPP02771 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFPP02771 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFPP02771 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AFPP02771 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AFPP02771 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
AFPP02771 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
AFPP02771 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AFPP02771 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AFPP02771 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFPP02771 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFPP02771 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFPP02771 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AFPP02771 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AFPP02771 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFPP02771 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFPP02771 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFPP02771 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFPP02771 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AFPP02771 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFPP02771 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFPP02771 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFPP02771 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFPP02771 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AFPP02771 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
AFPP02771 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFPP02771 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
AFPP02771 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AFPP02771 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
AFPP02771 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms