Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HLA-DQB1P01920 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HLA-DQB1P01920 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
HLA-DQB1P01920 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
HLA-DQB1P01920 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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