Protein–RNA interactions for Protein: O95407

TNFRSF6B, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 6B, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF6BO95407 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF6BO95407 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TNFRSF6BO95407 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TNFRSF6BO95407 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TNFRSF6BO95407 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TNFRSF6BO95407 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TNFRSF6BO95407 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms