Protein–RNA interactions for Protein: O95183

VAMP5, Vesicle-associated membrane protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP5O95183 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
VAMP5O95183 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
VAMP5O95183 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
VAMP5O95183 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
VAMP5O95183 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
VAMP5O95183 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms