Protein–RNA interactions for Protein: O94855

SEC24D, Protein transport protein Sec24D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24DO94855 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SEC24DO94855 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SEC24DO94855 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SEC24DO94855 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SEC24DO94855 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SEC24DO94855 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms