Protein–RNA interactions for Protein: O75783

RHBDL1, Rhomboid-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDL1O75783 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RHBDL1O75783 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RHBDL1O75783 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RHBDL1O75783 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RHBDL1O75783 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RHBDL1O75783 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms