Protein–RNA interactions for Protein: O75679

RFPL3, Ret finger protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFPL3O75679 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RFPL3O75679 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RFPL3O75679 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RFPL3O75679 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RFPL3O75679 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFPL3O75679 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms