Protein–RNA interactions for Protein: O75365

PTP4A3, Protein tyrosine phosphatase type IVA 3, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A3O75365 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PTP4A3O75365 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PTP4A3O75365 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PTP4A3O75365 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PTP4A3O75365 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PTP4A3O75365 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms