Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM24O75264 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM24O75264 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SMIM24O75264 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SMIM24O75264 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SMIM24O75264 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SMIM24O75264 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SMIM24O75264 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms