Protein–RNA interactions for Protein: O60810

PRAMEF4, PRAME family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF4O60810 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF4O60810 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRAMEF4O60810 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRAMEF4O60810 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PRAMEF4O60810 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF4O60810 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms