Protein–RNA interactions for Protein: O60318

MCM3AP, Germinal-center associated nuclear protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3APO60318 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
MCM3APO60318 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MCM3APO60318 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.26
MCM3APO60318 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MCM3APO60318 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MCM3APO60318 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms