Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYNGR1O43759 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SYNGR1O43759 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNGR1O43759 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SYNGR1O43759 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms