Protein–RNA interactions for Protein: O43639

NCK2, Cytoplasmic protein NCK2, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK2O43639 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCK2O43639 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCK2O43639 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCK2O43639 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NCK2O43639 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCK2O43639 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCK2O43639 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCK2O43639 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NCK2O43639 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCK2O43639 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCK2O43639 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NCK2O43639 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCK2O43639 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NCK2O43639 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCK2O43639 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCK2O43639 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NCK2O43639 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCK2O43639 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCK2O43639 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NCK2O43639 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCK2O43639 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NCK2O43639 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCK2O43639 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NCK2O43639 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCK2O43639 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCK2O43639 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCK2O43639 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCK2O43639 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NCK2O43639 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
NCK2O43639 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NCK2O43639 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCK2O43639 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NCK2O43639 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCK2O43639 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCK2O43639 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NCK2O43639 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NCK2O43639 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCK2O43639 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCK2O43639 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCK2O43639 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCK2O43639 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NCK2O43639 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NCK2O43639 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCK2O43639 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCK2O43639 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NCK2O43639 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NCK2O43639 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCK2O43639 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NCK2O43639 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCK2O43639 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCK2O43639 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCK2O43639 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCK2O43639 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NCK2O43639 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCK2O43639 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NCK2O43639 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCK2O43639 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCK2O43639 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCK2O43639 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NCK2O43639 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCK2O43639 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCK2O43639 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCK2O43639 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NCK2O43639 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCK2O43639 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NCK2O43639 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCK2O43639 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCK2O43639 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCK2O43639 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NCK2O43639 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCK2O43639 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NCK2O43639 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NCK2O43639 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCK2O43639 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NCK2O43639 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCK2O43639 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCK2O43639 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NCK2O43639 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NCK2O43639 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
NCK2O43639 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
NCK2O43639 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCK2O43639 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NCK2O43639 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 145.3 ms