Protein–RNA interactions for Protein: O43524

FOXO3, Forkhead box protein O3, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO3O43524 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
FOXO3O43524 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.77■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
FOXO3O43524 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.31
FOXO3O43524 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC35.66■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
FOXO3O43524 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC35.61■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
FOXO3O43524 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
FOXO3O43524 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC35.46■■■■□ 3.27
FOXO3O43524 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
FOXO3O43524 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms