Protein–RNA interactions for Protein: O15514

POLR2D, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2DO15514 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR2DO15514 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
POLR2DO15514 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
POLR2DO15514 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
POLR2DO15514 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
POLR2DO15514 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
POLR2DO15514 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
POLR2DO15514 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms