Protein–RNA interactions for Protein: O15049

N4BP3, NEDD4-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP3O15049 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
N4BP3O15049 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
N4BP3O15049 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
N4BP3O15049 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
N4BP3O15049 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
N4BP3O15049 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
N4BP3O15049 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms