Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
BCKDKO14874 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
BCKDKO14874 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
BCKDKO14874 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
BCKDKO14874 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
BCKDKO14874 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms