Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
RFXAPO00287 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RFXAPO00287 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
RFXAPO00287 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RFXAPO00287 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFXAPO00287 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFXAPO00287 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFXAPO00287 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFXAPO00287 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
RFXAPO00287 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFXAPO00287 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFXAPO00287 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
RFXAPO00287 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RFXAPO00287 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFXAPO00287 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
RFXAPO00287 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.56■■■□□ 2
RFXAPO00287 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RFXAPO00287 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFXAPO00287 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RFXAPO00287 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
RFXAPO00287 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.54■■■□□ 2
RFXAPO00287 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFXAPO00287 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
RFXAPO00287 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFXAPO00287 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RFXAPO00287 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RFXAPO00287 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.53■■■□□ 2
RFXAPO00287 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
RFXAPO00287 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RFXAPO00287 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFXAPO00287 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
RFXAPO00287 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.52■■■□□ 2
RFXAPO00287 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
RFXAPO00287 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
RFXAPO00287 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
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