Protein–RNA interactions for Protein: E9PAV3

NACA, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha, muscle-specific form, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACAE9PAV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NACAE9PAV3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NACAE9PAV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NACAE9PAV3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NACAE9PAV3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms