Protein–RNA interactions for Protein: C9JN71

ZNF878, Zinc finger protein 878, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF878C9JN71 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF878C9JN71 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF878C9JN71 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF878C9JN71 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZNF878C9JN71 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZNF878C9JN71 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms