Protein–RNA interactions for Protein: B9A030

TISP43, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TISP43B9A030 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TISP43B9A030 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TISP43B9A030 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TISP43B9A030 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TISP43B9A030 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TISP43B9A030 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TISP43B9A030 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TISP43B9A030 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
TISP43B9A030 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms