Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HNRNPCL3B7ZW38 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HNRNPCL3B7ZW38 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HNRNPCL3B7ZW38 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HNRNPCL3B7ZW38 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HNRNPCL3B7ZW38 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.9 ms