Protein–RNA interactions for Protein: B0FP48

UPK3BL1, Uroplakin-3b-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BL1B0FP48 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
UPK3BL1B0FP48 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
UPK3BL1B0FP48 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
UPK3BL1B0FP48 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
UPK3BL1B0FP48 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UPK3BL1B0FP48 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.6 ms