Protein–RNA interactions for Protein: A8MPY1

GABRR3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit rho-3, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRR3A8MPY1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GABRR3A8MPY1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GABRR3A8MPY1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GABRR3A8MPY1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABRR3A8MPY1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABRR3A8MPY1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms