Protein–RNA interactions for Protein: A8KAH6

HSPB2, Heat shock 27kDa protein 2, isoform CRA_a, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPB2A8KAH6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HSPB2A8KAH6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPB2A8KAH6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPB2A8KAH6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPB2A8KAH6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HSPB2A8KAH6 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms