Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WASHC1A8K0Z3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WASHC1A8K0Z3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
WASHC1A8K0Z3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
WASHC1A8K0Z3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 174.1 ms