Protein–RNA interactions for Protein: A4QN01

LINC01553, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01553, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01553A4QN01 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
LINC01553A4QN01 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC01553A4QN01 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC01553A4QN01 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC01553A4QN01 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC01553A4QN01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.58■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC01553A4QN01 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms