Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GVD1

FAM237B, Family with sequence similarity 237 member B, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM237BA0A1B0GVD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
FAM237BA0A1B0GVD1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
FAM237BA0A1B0GVD1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
FAM237BA0A1B0GVD1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
FAM237BA0A1B0GVD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms