Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQW1

LOC100506127, Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOC100506127A0A0U1RQW1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LOC100506127A0A0U1RQW1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LOC100506127A0A0U1RQW1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
LOC100506127A0A0U1RQW1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOC100506127A0A0U1RQW1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOC100506127A0A0U1RQW1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms