Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PFDN5Q99471 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PFDN5Q99471 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 334 ms