Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6B7

AP4B1, AP-4 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP4B1Q9Y6B7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
AP4B1Q9Y6B7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
AP4B1Q9Y6B7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
AP4B1Q9Y6B7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
AP4B1Q9Y6B7 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AP4B1Q9Y6B7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms