Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TRAPPC1Q9Y5R8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.74
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRAPPC1Q9Y5R8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.7 ms