Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I0

PCDHA13, Protocadherin alpha-13, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA13Q9Y5I0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHA13Q9Y5I0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHA13Q9Y5I0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
PCDHA13Q9Y5I0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PCDHA13Q9Y5I0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms