Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E7

PCDHB2, Protocadherin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB2Q9Y5E7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PCDHB2Q9Y5E7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PCDHB2Q9Y5E7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PCDHB2Q9Y5E7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCDHB2Q9Y5E7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
PCDHB2Q9Y5E7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PCDHB2Q9Y5E7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms