Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y543

HES2, Transcription factor HES-2, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HES2Q9Y543 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HES2Q9Y543 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
HES2Q9Y543 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
HES2Q9Y543 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
HES2Q9Y543 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HES2Q9Y543 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HES2Q9Y543 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms