Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ZNF330Q9Y3S2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ZNF330Q9Y3S2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ZNF330Q9Y3S2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ZNF330Q9Y3S2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
ZNF330Q9Y3S2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
ZNF330Q9Y3S2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
ZNF330Q9Y3S2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72 ms