Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q9

MRPS28, 28S ribosomal protein S28, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS28Q9Y2Q9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS28Q9Y2Q9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS28Q9Y2Q9 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS28Q9Y2Q9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MRPS28Q9Y2Q9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MRPS28Q9Y2Q9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms