Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2H6

FNDC3A, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNDC3AQ9Y2H6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
FNDC3AQ9Y2H6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FNDC3AQ9Y2H6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FNDC3AQ9Y2H6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FNDC3AQ9Y2H6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
FNDC3AQ9Y2H6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms