Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y297

BTRC, F-box/WD repeat-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BTRCQ9Y297 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
BTRCQ9Y297 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BTRCQ9Y297 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
BTRCQ9Y297 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
BTRCQ9Y297 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BTRCQ9Y297 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms