Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y285

FARSA, Phenylalanine--tRNA ligase alpha subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSAQ9Y285 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FARSAQ9Y285 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FARSAQ9Y285 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FARSAQ9Y285 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FARSAQ9Y285 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FARSAQ9Y285 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms