Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC31.52■■■□□ 2.64
TTF2Q9UNY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC31.47■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
TTF2Q9UNY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
TTF2Q9UNY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TTF2Q9UNY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TTF2Q9UNY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
TTF2Q9UNY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
TTF2Q9UNY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
TTF2Q9UNY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
TTF2Q9UNY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
TTF2Q9UNY4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
TTF2Q9UNY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC31.29■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
TTF2Q9UNY4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
TTF2Q9UNY4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms