Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF18Q9UNG2 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF18Q9UNG2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
TNFSF18Q9UNG2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
TNFSF18Q9UNG2 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
TNFSF18Q9UNG2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms