Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN66

PCDHB8, Protocadherin beta-8, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB8Q9UN66 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB8Q9UN66 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB8Q9UN66 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB8Q9UN66 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB8Q9UN66 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB8Q9UN66 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB8Q9UN66 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHB8Q9UN66 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
PCDHB8Q9UN66 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PCDHB8Q9UN66 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PCDHB8Q9UN66 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PCDHB8Q9UN66 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB8Q9UN66 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PCDHB8Q9UN66 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB8Q9UN66 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB8Q9UN66 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PCDHB8Q9UN66 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms