Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULI2

RIMKLB, Beta-citrylglutamate synthase B, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLBQ9ULI2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RIMKLBQ9ULI2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RIMKLBQ9ULI2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RIMKLBQ9ULI2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
RIMKLBQ9ULI2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RIMKLBQ9ULI2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RIMKLBQ9ULI2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms