Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDH7Q9ULB5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDH7Q9ULB5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CDH7Q9ULB5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CDH7Q9ULB5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CDH7Q9ULB5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CDH7Q9ULB5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CDH7Q9ULB5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.3 ms