Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
GJD2Q9UKL4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
GJD2Q9UKL4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
GJD2Q9UKL4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
GJD2Q9UKL4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
GJD2Q9UKL4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GJD2Q9UKL4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GJD2Q9UKL4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms