Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC42.9■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TNIKQ9UKE5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.85■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC42.84■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
TNIKQ9UKE5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.8■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC42.78■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
TNIKQ9UKE5 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC42.7■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TNIKQ9UKE5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC42.69■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.68■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC42.68■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC42.64■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
TNIKQ9UKE5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
TNIKQ9UKE5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
TNIKQ9UKE5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
TNIKQ9UKE5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
TNIKQ9UKE5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
TNIKQ9UKE5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TNIKQ9UKE5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
TNIKQ9UKE5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
TNIKQ9UKE5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
TNIKQ9UKE5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
TNIKQ9UKE5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
TNIKQ9UKE5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
TNIKQ9UKE5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
TNIKQ9UKE5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC42.51■■■■■ 4.4
TNIKQ9UKE5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC42.5■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.49■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.48■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.46■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
TNIKQ9UKE5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC42.43■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC42.41■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC42.39■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC42.38■■■■■ 4.38
TNIKQ9UKE5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
TNIKQ9UKE5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
TNIKQ9UKE5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms