Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
MID2Q9UJV3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
MID2Q9UJV3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
MID2Q9UJV3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MID2Q9UJV3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MID2Q9UJV3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.7 ms