Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHK0

NUFIP1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUFIP1Q9UHK0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUFIP1Q9UHK0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
NUFIP1Q9UHK0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
NUFIP1Q9UHK0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NUFIP1Q9UHK0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NUFIP1Q9UHK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.7 ms