Protein–RNA interactions for Protein: Q9UDT6

CLIP2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,046 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP2Q9UDT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLIP2Q9UDT6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
CLIP2Q9UDT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
CLIP2Q9UDT6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
CLIP2Q9UDT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CLIP2Q9UDT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC30.53■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.48
CLIP2Q9UDT6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
CLIP2Q9UDT6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
CLIP2Q9UDT6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms